Institut für Medical Data Science
Haus 02
Leipziger Str. 44
39120 Magdeburg
Tel.:+49 391 6713544
Profil • Service • Methodik • Ausstattung
Forschungsprofil
Medizinische Informatik für Forschungsinfrastrukturen
Der Bereich der Medizinischen Informatik befasst sich mit der Planung und dem Aufbau von medizinischen Informationssystemen und IT-Forschungsinfrastrukturen in Forschung und Lehre. Als zentrale Infrastruktur wurde das Datenintegrationszentrum aufgebaut um Daten aus den IT-Primärsystemen für Forschungszwecke verfügbar zu machen.
Künstliche Intelligenz in der Medizin
Die Methoden der Künstlichen Intelligenz beherrschen wir im gesamten Spektrum medizinischer Daten, von medizinischen Freitexten durch Large Language Modelle und Biosignaldaten oder Bildgebung über CNNs oder spezielle Transformeransätze.
Medizinische Bioinformatik
Seit Juli 2025 wurde eine neue Abteilung am IMDS für Medizinische Bioinformatik etabliert. Sie beschäftigt sich mit der Analyse von molekularen Daten wie
zur Beantwortung grundlagenwissenschaftlicher Fragestellungen. Darüber hinaus entwickeln wir interaktive Dashboards zur Visualisierung von molekularen Daten zusammen mit klinischen Daten. Durch die enge Verzahnung mit den Methoden aus der Medizininformatik, Biostatistik und Künstlichen Intelligenz entstehen innovative Ansätze für die Analyse komplexer Gesundheitsdaten, die unter anderem in klinische Dashboards mit individuellen Auswertungen resultieren.
Medizinische Biometrie
Lehre und Beratungstätigkeit sind die Hauptschwerpunkte der Arbeitsgruppe Biometrie.
Die biometrische Beratung für medizinische Forschungsprojekte steht allen Mitgliedern der Universitätsmedizin Magdeburg zur Verfügung. Die Beratung kann sich auf Versuchsplanung, Hinweise zur Datenerfassung, statistische Auswertung und Interpretation der Ergebnisse beziehen. Sie umfasst die Unterstützung bei
- wissenschaftlichen Arbeiten (Promotionen, Habilitationen),
- medizinischen Publikationen,
- Tierversuchsanträgen sowie
- klinischen Studien.
Es bestehen enge, zum Teil langjährige Kooperationsbeziehungen zu einer Vielzahl von Instituten und Kliniken der Medizinischen Fakultät. Diese Kooperationen entstehen häufig aus den Beratungen der Arbeitsgruppe heraus, wonach dann auch umfangreichere Arbeiten von uns übernommen werden, die häufig mit der Planung und Auswertung von klinischen oder experimentellen Studien verbunden sind. Der Stellenwert dieser Arbeiten an unserer Arbeitsgruppe lässt sich auch an der Publikationsliste des Instituts erkennen, wo viele Arbeiten enthalten sind, die aus enger Zusammenarbeit mit Partnern der Fakultät entstanden sind.
Ebenfalls enge Kooperationsbeziehungen bestehen zum Koordinierungszentrum für Klinische Studien (KKS) Magdeburg, das mit Unterstützung des Instituts für Biometrie und Medizinische Informatik aufgebaut wurde.
Im Rahmen des von der DFG geförderten Graduiertenkollegs GRK2413 bot der Bereich Biometrie im Jahr 2022 den Workshop „Datenmanagement und Biometrie II für Medizindoktoranden“ an.
Der Bereich der Medizinischen Informatik befasst sich mit der Planung und dem Aufbau von medizinischen Informationssystemen und IT-Forschungsinfrastrukturen in Forschung und Lehre. Als zentrale Infrastruktur wurde das Datenintegrationszentrum aufgebaut um Daten aus den IT-Primärsystemen für Forschungszwecke verfügbar zu machen.
- Datenintegrationszentrum im Rahmen der Medizininformatik-Initiative
- Forschungsdatenmanagement
- Patientenapps und Smart Devices
- Clinical Data Management
- Treuhandstelle
Künstliche Intelligenz in der Medizin
Die Methoden der Künstlichen Intelligenz beherrschen wir im gesamten Spektrum medizinischer Daten, von medizinischen Freitexten durch Large Language Modelle und Biosignaldaten oder Bildgebung über CNNs oder spezielle Transformeransätze.
- Vorhersagen oder Klassifikationen von medizinischen Daten (Bildern, Zeitserien, Tabellendaten, Freitexten)
- Segmentierung oder Annotationen von medizinischen Bilder (2D und 3D)
- Verfahren zur klininischen Entscheidungsunterstützung und Beratung regulatorischer Aspekte wie EU-MDR/IVDR und EU-AI Act
Medizinische Bioinformatik
Seit Juli 2025 wurde eine neue Abteilung am IMDS für Medizinische Bioinformatik etabliert. Sie beschäftigt sich mit der Analyse von molekularen Daten wie
- DNA
- RNA
- scRNA, spatial Transcriptomics
- Multi-OMICS
zur Beantwortung grundlagenwissenschaftlicher Fragestellungen. Darüber hinaus entwickeln wir interaktive Dashboards zur Visualisierung von molekularen Daten zusammen mit klinischen Daten. Durch die enge Verzahnung mit den Methoden aus der Medizininformatik, Biostatistik und Künstlichen Intelligenz entstehen innovative Ansätze für die Analyse komplexer Gesundheitsdaten, die unter anderem in klinische Dashboards mit individuellen Auswertungen resultieren.
Medizinische Biometrie
Lehre und Beratungstätigkeit sind die Hauptschwerpunkte der Arbeitsgruppe Biometrie.
Die biometrische Beratung für medizinische Forschungsprojekte steht allen Mitgliedern der Universitätsmedizin Magdeburg zur Verfügung. Die Beratung kann sich auf Versuchsplanung, Hinweise zur Datenerfassung, statistische Auswertung und Interpretation der Ergebnisse beziehen. Sie umfasst die Unterstützung bei
- wissenschaftlichen Arbeiten (Promotionen, Habilitationen),
- medizinischen Publikationen,
- Tierversuchsanträgen sowie
- klinischen Studien.
Es bestehen enge, zum Teil langjährige Kooperationsbeziehungen zu einer Vielzahl von Instituten und Kliniken der Medizinischen Fakultät. Diese Kooperationen entstehen häufig aus den Beratungen der Arbeitsgruppe heraus, wonach dann auch umfangreichere Arbeiten von uns übernommen werden, die häufig mit der Planung und Auswertung von klinischen oder experimentellen Studien verbunden sind. Der Stellenwert dieser Arbeiten an unserer Arbeitsgruppe lässt sich auch an der Publikationsliste des Instituts erkennen, wo viele Arbeiten enthalten sind, die aus enger Zusammenarbeit mit Partnern der Fakultät entstanden sind.
Ebenfalls enge Kooperationsbeziehungen bestehen zum Koordinierungszentrum für Klinische Studien (KKS) Magdeburg, das mit Unterstützung des Instituts für Biometrie und Medizinische Informatik aufgebaut wurde.
Im Rahmen des von der DFG geförderten Graduiertenkollegs GRK2413 bot der Bereich Biometrie im Jahr 2022 den Workshop „Datenmanagement und Biometrie II für Medizindoktoranden“ an.
Serviceangebot
- LLM-Plattform für Forschende auch unter Nutzung von sensiblen Patientendaten
- Statistische Beratungen und GCP-konformes Datenmanagement für klinische Studien.
- Datenintegrationszentrum und Forschungsdatenmanagement klinischer Routinedaten.
- Treuhandstelle.
- Weiterbildung für Klinische Studien (zusammen mit KKS (AMG-Kurs).
- Forschungsdatenmanagement.
Geräte/Ausrüstungen
- Linux-Cluster
- NMR Spektrometer Bruker WB-300 Ultrashield
- Oculus Rift DK2
- 3D Drucker
- EEG, 64 Kanal, MR-Kompatibel
- Messzeit am 7T Human-Magnetresonanz-Tomograph (FNW)
- Messzeit am 3T MRT (Klinik für Neurologie), Virtual Reality Umgebungen
- Anregungseinheit Elastographie
- MR-Elastographie Anregungseinheit für 3T MRT
- Lowfield (0.6T) NMR/MRI für 1H/19F/X-Kerne
Personen • Projekte • Kooperationen
Personenliste
- Baecke, Sebastian; Dr.
- Berger, Jakob; B.Sc.
- Bernarding, Johannes; Prof. Dr. Dr.
- Bickmann, Lucas; M.Sc.
- Bruns, Christian; Dr. rer. nat.
- Euchner, Frederike; M.Sc.
- Glimm, Ekkehard; apl. Prof. Dr.
- Herrmann, Tim; Dr.-Ing.
- Kropf, Siegfried; apl. Prof. Dr.
- Lux, Anke; Dipl.-Math.
- Lützkendorf, Ralf; Dr.
- Sandmann, Sarah; Priv.-Doz. Dr. rer. med. habil.
- Varghese, Julian; Prof. Dr. med.
Projektliste
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Kooperationsliste
- Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
- Averbis GmbH
- Deutsches Krebsforschungszentrum in Heidelberg AG Hochfeld Ganzkörper MR (7T)
- Dr. André Brechmann, Leibniz-Institut für Neurobiologie, Magdeburg
- Dr. Glimm, Sieder, Novartis, Nürnberg/Basel
- Dr. Jonas Warneke, Universität Leipzig, Wilhelm-Ostwald-Institut für Physikalische und Theoretische Chemie
- Dr. Jörg Stadler (Leibniz-Institut für Neurobiologie)
- Dr. Kai Buckenmaier, Max-Planck-Institut für biologische Kybernetik Tübingen
- Dr. N. Weiskopf, FIL, London
- Dr. Vladimir A. Azov, University of the Free State, Department of Chemistry, Bloemfontein, South Africa
- Dr. rer. nat. Jörn Kaufmann, Klinik für Neurologie
- Fachbereich Gesundheit - Technische Hochschule Mittelhessen
- Institut für Medizinische Biometrie und Statistik - Universitätsklinikum Freiburg
- Institut für Medizinische Biometrie, Epidemiologie und Informatik - Universitätsmedizin der Johannes Gutenberg-Universität Mainz
- Institut für Medizinische Informatik - Hochschule Mannheim
- Klinik für Neurologie, Prof. Dr. H.J. Heinze
- Lehrstuhl für Medizinische Informatik - Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg
- Medizinische Fakultät - Justus-Liebig-Universität Gießen
- Medizinische Fakultät - Philipps Universität Marburg
- Medizinische Fakultät Mannheim - Ruprecht-Karls-Universität Heidelberg
- PD Dr. J. Braun, Prof. Dr. Ingolf Sack, Charité Berlin
- Prof. Dr. Ewald Moser (Medizinsche Universität Wien)
- Prof. Dr. Daniel Erni (Lehrstuhl für Allgemeine und Theoretische Elektrotechnik (ATE) der Universität Duisburg-Essen)
- Prof. Dr. Gerd Buntkowsky, TU Darmstadt, Physikalische Chemie
- Prof. Dr. Klaus Solbach (Lehrstuhl für Hochfrequenztechnik der Universität Duisburg-Essen)
- Prof. Dr. Zang-Hee Cho (Neuroscience Research Institute (NRI) der Gachon Universität in Südkorea
- Prof. Schwabe, OvGU Magdeburg
- Universitätsklinikum Carl Gustav Carus Dresden
- Universitätsklinikum Frankfurt, Medizinischen Klinik 2 - Goethe-Universität Frankfurt
- Universitätsmedizin Greifswald
Publikationen
Publikationsliste
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