HAPPAN : Haplotyp und pan-genomische Erschließung der multiparentalen Wildgerste Population HEB-25 zur vollständigen Nutzbarmachung der Ressource für die Züchtung neuer Gerstesorten mit verbesserter Anpassung an sich verändernden Umweltbedingungen.

Ziel des HAPPAN-Projekts ist die Erstellung einer Genom-Referenzsequenz einer Wildgerste- Akzessionen der HEB-25-Population. Darüber hinaus wird die vollständige Sequenzierung aller 25 Wildgersteneltern der HEB-25 angestrebt. Durch den Vergleich von domestizierter und wilder Gerste erwarten wir, dass Positionen mit großen strukturellen Variationen identifiziert und das Pan-Genom der Wildgerste definieren werden können. Anschließend werden diese Pan-Genomdaten verwendet, um die gesamte Population von insgesamt 1.420 Linien dieser sogenannten NAM Population (Nested Association Mapping) zu entschlüsseln. Dies wird die Detektion großer Sequenzvariationen, die Definition eines genomweiten Satz von DNA-Markern mit hoher Dichte und die Ermittlung neuartiger Variationen und Gene ermöglichen, die in domestizierten Gerstenlinien unerschlossen sind.
Die Integration kürzlich veröffentlichter GBS-Markerdaten aus ~20.000 Gerste Akzessionen (Genbank IPK Gatersleben) wird die Verknüpfung unserer Ressource mit der globalen Gerstensammlung ermöglichen. Darüber hinaus werden die im Projekt erhobenen, genomweiten Daten aller 25 Wildgerste-Eltern die Definition eines HAP100k-SNP-Kerndatensatzes zum Ziel haben. Diese Ressource wird das Design eines Genotypisierungs Panels ermöglichen, das direkt auf große Genotypsammlungen anwendbar ist und eine nochmals verbesserter Repräsentation des Gen-Repertoires der Gerste aufweist, inklusive neuer Allele.