PaCeQuant - ein neues Software-Tool zur Hochdurchsatz-Analyse von Pavement-Zellen

Das neue ImageJ/Fiji-Plugin PaCeQuant unterstützt die Analyse der Formparameter von Pavement-Zellen auf Basis von Mikroskopbildern. Der Schwerpunkt des Tools liegt dabei auf einer Analyse möglichst aller in einem Bild sichtbaren Zellen. Damit wird es erstmals möglich, eine Vielzahl verschiedener Formparameter auch für große Datensätze, die eine hohe Anzahl von Bildern umfassen, zu extrahieren und repräsentativere Datensätze zu Formparametern individueller Wildtypen und Mutanten zu erzeugen.

PaCeQuant wurde ursprünglich für die Quantifizierung von Formparametern für Pavement-Zellen entwickelt, die extrahierten Maßzahlen sind aber in weiten Teilen so generisch, dass es sich auch für vergleichbare Fragestellungen in anderen Anwendungsbereichen einsetzen lässt.

PaCeQuant: A Tool for High-Throughput Quantification of Pavement Cell Shape Characteristics , Birgit Möller, Yvonne Poeschl, Romina Plötner, Katharina Bürstenbinder, Plant Physiology, Nov 2017, 175 (3) 998-1017; DOI: 10.1104/pp.17.00961