INET - BiTca Bioinformatisches Tool zur Regelung mikrobieller Prozesse

In diesem Projekt sollen Biokatalysatoren auf der Einzelzellebene in Bioreaktorumgebungen zeitnah (near-online) mittels Durchflusszytometrie gemessen werden und resultierende Daten segregiert einem Steuerungskonzept zur Verfügung gestellt werden. Die Analyse von Zelleigenschaften soll zu Regelungsentscheidungen führen. Zur Auswertung der Einzelzell-Datensätze sind bioinformatische Tools notwendig, von denen einige in den letzten Jahren entwickelt worden sind, wie z.B. die Quantifizierung und Visualisierung von Strukturänderungen in mikrobiellen Gemeinschaften über die Zeit oder in Abhängigkeit von Reaktordesigns bzw. Fahrweisen.Zwischen zytometrischer Einzelzellmessung und automatischer Datenverwertung ist jedoch zunächst eine Clusterung (Segregation) von zellbasierten Daten notwendig, die aktuell auf Grund von Expertenwissen per Hand vorgenommen wird. In diesem Projekt wird angestrebt, diesen Schritt ebenfalls zu automatisieren und personenunabhängig zu entwickeln, um zum einen einer smarten Datenerfassung und -auswertung nahe zu kommen und zum anderen individuelle Fehler von Anwendern zu minimieren.