Mammakarzinomzellen mit Fokus auf die Mechanismen des dreidimensionalen Wachstums. Zu dessen Erreichung unterteilt sich das beantragte Forschungsvorhaben in zwei wissenschaftliche und technologische Teilziele:
AMCRIS-AP1: Integration bildanalytischer KI-Verfahren fu¨r die Optimierung der Auswertung von unter s-µg und r-µg aufgenommenen hochauflösenden FLUMIAS Bilddaten. Von der KI-gestu¨tzten Bildanalyse erwarten wir:
1. Identifikation und Tracking von Sphäroiden sowie Identifikation und gesicherte Quantifizierung
intrazellulärer molekularer Strukturen und Organellen
2. Generierung von 3D Sphäroid-Modellen unter Verwendung von FLUMIAS Z-Stack Aufnahmen
3. Eine klare Differenzierung von Präparationsartefakten zu Zell- und Zellcluster-Eigenschaften
AMCRIS-AP2: Projektu¨bergreifende Analyse der unter r- und s-µg gewonnenen RNAseq-Daten unter Einbeziehung von ¨Deep Learning¨ Algorithmen und deren analytische Verknu¨pfung mit generellen und eigenen unter Langzeit-µg ermittelten epigenetischen Daten. Von der KI-gestu¨tzten Datenanalyse erwarten wir:
1. Identifikation von µg-verursachten epigenetischen, transkriptionellen und proteomischen Effekten
2. Differenzierung von µg-verursachten und/oder erkrankungsdiskriminierenden Genklassen
3. Differenzierung von zelltypspezifischen, erkrankungsspezifischen und u¨bergreifenden Effekten.
4. Durch anschließende Interaktionsnetzwerkanalysen erwarten wir eine präzise Abbildung der Signalwege µg-basierter Differenzierung und Veränderung von Tumorzellen.
Durch Kombination der Teilvorhaben AMCRIS-AP1 und AMCRIS-AP2 soll ein physiologisch-biochemisches 3D-Modell der Sphäroid-Bildung als Modell fu¨r die Metastasierung von Tumoren entwickelt werden.
Kooperationen im Projekt
- • Universitätsmedizin Greifswald (Vorhaben XTRAS), Greifswald Deutschland (50WK2270I)
- • Johann Wolfgang Goethe-Universität Frankfurt am Main, Frankfurt am Main (50WK2270H)
- • BTU Cottbus-Senftenberg (AIDIA), Cottbus Deutschland (50WK2270F)
- • Hochschule Mittweida University of Applied Sciences, Mittweida (50WK2270E)
- • Universität zu Köln (Vorhaben AIGE), Köln Deutschland (50WK2270D)
- • Universität Duisburg-Essen (Vorhaben AIDEX), Essen Deutschland (50WK2270C)
- • Technische Hochschule Mittelhessen - University of Applied Scienes (Vorhaben AIPEX), Gießen Deutschland (50WK2270B)
- • Hochschule Mittweida University of Applied Sciences, Mittweida (50WK2270A)
Prof. Dr. med. Daniela Grimm
Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg
Universitätsklinik für Plastische, Ästhetische und Handchirurgie
Abteilung für Mikrogravitation und Translationale Regenerative Medizin
Universitätsplatz 2
39106
Magdeburg
Tel.:+49 391 6757599