Identifikation des indirekten p53 Genregulationsnetzwerkes

Wir untersuchen, wie der Tumorsuppressor p53 seine vielfältigen Zielgene reguliert und welche zusätzlichen Transkriptionsfaktoren dabei eine Rolle spielen. Obwohl p53 zentral für die Tumorsuppression ist, indem es Zellproliferation und Apoptose steuert, sind die molekularen Mechanismen seines Genregulationsnetzwerks noch unvollständig verstanden. Aufbauend auf früheren Arbeiten identifizierten wir den p53-RFX7-Signalweg und zeigten, dass RFX7 ein eigenes Tumorsuppressor-Gennetzwerk als Reaktion auf p53 Signalgebung und zellulären Stress aktiviert. In diesem Projekt entwickeln wir Methoden zur systematischen Identifizierung unbekannter Transkriptionsfaktoren. Mithilfe von CAGE-seq werden relevante Promotorregionen kartiert und mit DNA-Affinitätsreinigung und Massenspektrometrie kombiniert, um spezifische Bindungen an p53-responsive DNA-Elemente nachzuweisen. Transkriptionsfaktor-Kandidaten werden validiert und funktionell charakterisiert, um das Verständnis des p53-Netzwerks zu vertiefen, neue therapeutische Ansätze zu eröffnen und allgemein anwendbare Strategien zur Aufklärung weiterer Transkriptionsnetzwerke zu entwickeln.